定风量系统（设补风）：除投资方面省却了自动控制系统，但由于动力设备都是按初建设时满负荷设计和实施的，风机设备及管道的初投资较变风量系统高，但整体初投资还是较低。方案设计、实施简单，但实验室环境差、噪音大、能耗大。
变风量系统：增加了变风量控制系统的初投资，但由于变风量系统利于参差性设计（通风柜同时使用率）使得空间占用和动力设备配置相对减小，可节约部分土建建设成本及风机设备和通风管道的初投资，但整体初投资还是相对较高。
2.系统的控制管理：
定风量通风系统：通常没有自动管理设备，由于有害气体是观察不到的，实验人员甚至无法知道通风柜是否正常排风，实验室负压是否正确，风机等设备出现故障也不能第一时间发现，造成安全隐患。
变风量通风系统：采用自动管理设备，每个通风柜上有监视器，实时显示通风柜的运行状态及当前面风速，操作人员一目了然。系统出现不正常状态或故障时自动调整及发出报警，提高安全性及更合理利用资源。
3.系统的灵活性：
定风量通风系统：动力设备都是按初建设时满负荷设计和实施的，空间占用（通风管道）和动力设备（风机、动力站）都是最大配置且固定。当系统需要扩建时，原有动力设备都需要更换或增加，影响大，灵活性差。
变风量通风系统：利于参差性设计（通风柜同时使用率）使得空间占用和动力设备配置相对减小，可节约部分建设成本。并且当系统小规模扩建时，同样可利用变风量系统参差性，虽然通风柜数量增加，但同时使用率比原来降低，所以不必更换或增加原有动力设备，灵活性好。
因此变风量控制系统对于实验室的安全性、环境、节能方面能够有效改善，在上世纪中期欧美国家已普遍采用，已是很成熟的一套技术方案。目前在国内采用变风量系统在外资企业大中型实验室已是惯例，而国内企业的新建中央实验室取代普通传统的定风量排放方案已成为趋势，都陆续采用了实验室变风量整体控制系统，并收到明显的成效。